患儿感染肠道病毒EV71后，多以发热起病，一般为38℃左右。

部分病人早期有咳嗽流涕和流口水等类似上呼吸道感染的症状，有的孩子可能有恶心、呕吐等反应。

发热1～2天后开始出现皮疹，通常在手足、臀部出现，或出现口腔粘膜疱疹。

有的患儿不发热，只表现为手、足、臀部皮疹或疱疹性咽峡炎，病情较轻。大多数患儿在一周以内体温下降、皮疹消退，病情恢复。